Il laboratorio chimico è dotato delle più sofisticate strumentazioni analitiche disponibili, quali sistemi di gascromatografia (GC, GC/MS) e cromatografia liquida (HPLC), spettrofotometria A.A. in fiamma e in fornetto di grafite, polarografia e voltammetria, spettrofotometria FT-IR, visibile e UV, microscopia ottica MOCF. Inoltre è presente una sezione di analisi microbiologica specifica per le acque e per gli alimenti. Linea emissioni convogliate anche per diossine e furani.
Completano la dotazione di laboratorio i fonometri per le misurazioni del rumore, il misuratore di vibrazioni e i sistemi di campionamento di acque, terreni, aeriformi e polveri sottili (PM10).
